Аэропорт острова Наксос расположен в 3 километрах от городка Агиос Прокопий (Agios Prokopios). Официальное название: Аэропорт Наксос (Naxos Airport), код по системе IATA — JNX. В аэропорту есть кафе, магазины и банкоматы. Аэропорт обслуживает в основном рейсы из Афин греческих авиакомпаний Olympic Air и Aegean Airlines, однако в летний период принимает и чартеры из Европы.